Hlavným cieľom tohto projektu je vyvinúť molekulárnu metódu, pomocou ktorej budeme schopní transformovať rôzne flavoproteíny na účinné fotosenzibilizátory produkujúce singletový kyslík s vysokým kvantovým výťažkom. Vybrané flavoproteíny a vhodne navrhnuté mutanty budú exprimované v Escherichia coli a purifikované bežnými metódami. Vytvorené proteíny konjugujeme so špecifickými DARPin-mi (skupina navrhnutých ankyrínových repetitívnych proteínov – proteínová skupina, ktorá predstavuje analógy protilátok), ktoré špecificky rozpoznávajú receptory HER2. Tieto konjugáty sa použijú na bunkovej úrovni na demonštráciu ich účinnosti, tj. selektívnej väzby na bunky s receptormi HER2 a toxicity pripojených flavoproteínov vyvolanej svetlom. Pri dosiahnutí tohto cieľa získame nástroj na vytvorenie generickej metódy na transformáciu v zásade akýchkoľvek flavoproteínov na účinné fotosenzibilizátory.
Prijímajúci profesor: prof. RNDr. Pavol Miškovský, DrSc., E-mail: pavol.miskovsky@upjs.sk
Zodpovedný pracovník: doc. RNDr. Erik Sedlák, DrSc., E-mail: erik.sedlak@upjs.sk
Odborné požiadavky/kritériá:
Technologický a inovačný park
1. – kotva. Názov témy: Vývoj efektívnych geneticky kódovaných fotosenzibilizátorov
Anotácia:
Hlavným cieľom tohto projektu je vyvinúť molekulárnu metódu, pomocou ktorej budeme schopní transformovať rôzne flavoproteíny na účinné fotosenzibilizátory produkujúce singletový kyslík s vysokým kvantovým výťažkom. Vybrané flavoproteíny a vhodne navrhnuté mutanty budú exprimované v Escherichia coli a purifikované bežnými metódami. Vytvorené proteíny konjugujeme so špecifickými DARPin-mi (skupina navrhnutých ankyrínových repetitívnych proteínov – proteínová skupina, ktorá predstavuje analógy protilátok), ktoré špecificky rozpoznávajú receptory HER2. Tieto konjugáty sa použijú na bunkovej úrovni na demonštráciu ich účinnosti, tj. selektívnej väzby na bunky s receptormi HER2 a toxicity pripojených flavoproteínov vyvolanej svetlom. Pri dosiahnutí tohto cieľa získame nástroj na vytvorenie generickej metódy na transformáciu v zásade akýchkoľvek flavoproteínov na účinné fotosenzibilizátory.
Prijímajúci profesor: prof. RNDr. Pavol Miškovský, DrSc., E-mail: pavol.miskovsky@upjs.sk
Zodpovedný pracovník: doc. RNDr. Erik Sedlák, DrSc., E-mail: erik.sedlak@upjs.sk
Odborné požiadavky/kritériá:
Zisk titulu PhD. v študijnom programe Biofyzika (resp. príbuznom študijnom programe, napr. Biochémia, Molekulová biológia), minimálne tri publikácie publikované vo vedeckých časopisoch vedených v databáze WoS, minimálne na jednej z nich prvý alebo korešpondujúci autor, skúsenosti s expresiou a purifikáciou proteínov, ich charakterizáciou spektrálnymi a termodynamickými metódami.
2.-kotva1 Názov témy: Vývoj novej generácie cielených transportných systémov schopných viazať široké spektrum liečiv a vytvárať vysoko afinitnú väzbu so špecifickými receptormi na nádorových bunkách
Anotácia:
Vedecké úlohy v rámci tejto témy sú založené na súčasných poznatkoch v oblasti vývoja transportných systémov pre cielený transport liečiv. Navrhovaný transportný systém liečiv (DARLINK) je založený na rekombinantnej inovácii pozostávajúcej zo spojenia DARPinov – majúcich vysokú afinitu pre väzbu na špecifické receptory nádorových buniek – a endogénnych lipoproteínových nanočastíc, ktoré majú značnú kapacitu pre naviazanie hydrofóbnych resp. amfifilných liečiv. Konkrétne, navrhovaný transportný systém bude skonštruovaný fúziou molekúl LDL (alebo HDL) so špecifickými DARPinmi, ktoré majú vysokú afinitu pre naviazanie na HER2 receptory nachádzajúce sa na povrchu nádorových buniek mliečnej žľazy a taktiež DARPinmi vyselektovanými pre väzbu na prirodzenú a mutovanú formu EGFR, ktoré sú lokalizované na povrchu buniek pľúcnych nádorov. Bunky nádoru mliečnej žľazy boli vybrané ako modelový systém na validáciu účinnosti skonštruovaného transportného systému DARLINK. Modulárna štruktúra DARLINKu umožní začatie novej línie biomedicínsky orientovaného výskumu so značným dopadom na oblasť cielenej terapie. Konkrétnymi cieľmi výskumu v tejto téme sú: i) vývoj lipoproteínového transportného systému liečiv, ii) výskum optimalizácie komplexu DARPin/lipoproteínový transportný systém liečiv, iii) analýza záchytu komplexu DARLINK/liečivo modelovými bunkovými systémami a iv) stanovenie mechanizmu protinádorového účinku komplexu DARLINK/liečivo.
Prijímajúci profesor: prof. RNDr. Pavol Miškovský, DrSc., E-mail: pavol.miskovsky@upjs.sk
Zodpovedný pracovník: prof. RNDr. Pavol Miškovský, DrSc.
Odborné požiadavky/kritériá:
Zisk titulu PhD. v študijnom programe Biofyzika (resp. príbuznom študijnom programe, napr. Biochémia, Molekulová biológia), minimálne tri publikácie publikované vo vedeckých časopisoch vedených v databáze WoS, minimálne na jednej z nich prvý alebo korešpondujúci autor, skúsenosti s prácou v oblasti vývoja transportných systémov liečiv a prácou s bunkovými kultúrami
3. – kotva2 Názov témy: Magnetoimpedančný jav v multifunkčných materiáloch.
Anotácia:
Cieľom témy je preskúmať možnosť využitia magnetoimpedančného javu na snímanie externých parametrov (teplota, tlak, predĺženie a pod.) v multifunkčných materiáloch (napr. magnetokalorických, s tvarovou pamäťou, a pod.) na báze amorfných resp. kryštalických intermetalických zliatin. Vhodne zvoleným tvarom a anizotropiou modifikovať odozvu magnetoimpedančného javu na tieto externé parametre.
4.- kotva4 Prijímajúci profesor
fffffffffffffffffffffffffffffffffffffffffffffffff
Detailnejšie poznanie množinovej štruktúry reálnych čísel je dôležité napríklad pre lepšie pochopenie podstaty konvergencie, čo je v pozadí mnohých numerických iteračných algoritmov. Na druhej strane, účinným nástrojom výskumu štruktúry reálnych čísel sa stala teória hier a teória miery.
Vedecké úlohy v rámci tejto témy sú založené na súčasných poznatkoch v oblasti vývoja transportných systémov pre cielený transport liečiv. Navrhovaný transportný systém liečiv (DARLINK) je založený na rekombinantnej inovácii pozostávajúcej zo spojenia DARPinov – majúcich vysokú afinitu pre väzbu na špecifické receptory nádorových buniek – a endogénnych lipoproteínových nanočastíc, ktoré majú značnú kapacitu pre naviazanie hydrofóbnych resp. amfifilných liečiv. Konkrétne, navrhovaný transportný systém bude skonštruovaný fúziou molekúl LDL (alebo HDL) so špecifickými DARPinmi, ktoré majú vysokú afinitu pre naviazanie na HER2 receptory nachádzajúce sa na povrchu nádorových buniek mliečnej žľazy a taktiež DARPinmi vyselektovanými pre väzbu na prirodzenú a mutovanú formu EGFR, ktoré sú lokalizované na povrchu buniek pľúcnych nádorov. Bunky nádoru mliečnej žľazy boli vybrané ako modelový systém na validáciu účinnosti skonštruovaného transportného systému DARLINK. Modulárna štruktúra DARLINKu umožní začatie novej línie biomedicínsky orientovaného výskumu so značným dopadom na oblasť cielenej terapie. Konkrétnymi cieľmi výskumu v tejto téme sú: i) vývoj lipoproteínového transportného systému liečiv, ii) výskum optimalizácie komplexu DARPin/lipoproteínový transportný systém liečiv, iii) analýza záchytu komplexu DARLINK/liečivo modelovými bunkovými systémami a iv) stanovenie mechanizmu protinádorového účinku komplexu DARLINK/liečivo.