Laboratórium transmisnej elektrónovej mikroskopie (LEM) je pracoviskom Ústavu biologických a ekologických vied Prírodovedeckej fakulty UPJŠ v Košiciach. Laboratórium je lokalizované v suteréne RBL pavilónu na Šrobárovej 2. V laboratóriu je nainštalovaný transmisný elektrónový mikroskop JEOL JEM-1230 (high contrast) určený pre analýzy ultraštruktúry biologických vzoriek a analýzy imunoznačených vzoriek. Mikroskop je vybavený volfrámovou katódou s maximálnym urýchľovacím napätím 120 kV. Súčasťou mikroskopu je digitálna CCD kamera a softvér ITEM pre snímanie mikrofotografií. Mriežkové rozlíšenie je 0,2 nm a maximálne zväčšenie 600 000×.