Ústav fyzikálnych vied má širokú medzinárodnú vedeckú spoluprácu, z veľkých medzinárodných inštitúcií je možné menovať CERN Ženeva, SÚJV Dubna, ÚJF Jülich, DESY Hamburg, XFEL Hamburg, Argonne National Laboratory v USA, National High Magnetic Field Laboratory v USA, European High Magnetic Field Laboratory a ďalšie.