ENVIRONMENTÁLNA MIKROBIOLÓGIA
Vedeckým zameraním katedry je štúdium prokaryotických mikroorganizmov v extrémnych prostrediach so zameraním na hypersalinné prostredia soľaniek a slaných prameňov najmä z obdobia miocénu. Okrem štúdia diverzity mikrobioty týchto prostredí kultivačnými aj nekultivačnými prístupmi sa zameriavame na popis nových druhov prokaryot, genomické analýzy vybraných izolátov, analýzu molekulových adaptácií na hypersalinné prostredia a úlohu horizontálneho prenosu génov v tomto procese ako aj biotechnologické využitie izolátov, alebo nimi produkovaných extrémozýmov, v bioremediačných procesoch a na produkciu polyhydroxyalkanoátov, ako ekologickej a biodegradovateľnej náhrade dnes používaných plastov.
MOLEKULÁRNA DETEKCIA A TAXONÓMIA MIKROORGANIZMOV
Neoddeliteľnou súčasťou práce Katedry mikrobiológie je molekulárna detekcia, identifikácia a taxonómia všetkých typov mikroorganizmov od baktérií, cez archeóny, prvoky až po huby s využitím najmodernejších fylogenetických a fylogenomických analýz. Okrem analýzy jednotlivých taxónov získaných kultivačnými prístupmi s využitím klasických prístupov zameraných na rRNA marker, realizujeme molekulové analýzy komplexných mikrobiálnych spoločenstiev nekultivačnými prístupmi, najmä metagenomickými analýzami s cieľom analýzy vplyvu priestorovej izolácie ako hnacej sily prokaryotickej speciácie.
ČLENOVIA TÍMU:
doc. RNDr. Peter Pristaš, CSc., univerzitný profesor
RNDr. Jana Kisková, PhD.
RNDr. Mariana Kolesárová, PhD.
RNDr. Lenka Maliničová, PhD.
RNDr. Lea Nosáľová, PhD.
RNDr. Nikola Petrová, PhD.RNDr. Ivana Slepáková, PhD.
Doktorandi:
RNDr. Shivani Gaurangkumar Adhvaryu
RNDr. Soňa Brestovičová
RNDr. Michaela Cimermanová
Mgr. Zuzana Lorková Kellnerová
Mgr. Jakub Milčák
AKTUÁLNE RIEŠENÉ PROJEKTY:
CSIC-SAS-2024-01 PLASMEX, Unraveling the Plasmidome of Extremophilic Bacteria for Biotechnological Innovation (zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Peter Pristaš, CSc., univerzitný profesor)
VEGA 1/0779/21 Aktinobaktérie a aktinomycéty z extrémnych prostredí ako zdroj biodiverzity pre moderné biotechnológie (zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Peter Pristaš, CSc., univerzitný profesor)
VVGS 2024-3105 Fylogenomika a biotechnologický potenciál rodu Idiomarina (zodpovedný rieśiteľ RNDr. Soňa Brestovičová)
VVGS ESGD 2023-3009 Plazmidóm extrémofilných baktérii a jeho úloha v adaptácii baktérií na extrémne podmienky (zodpovedný riešiteľ: Mgr. Zuzana Lorková Kellnerová)
HUSKROUA/23/RS/1.2/027 EFFUSE-win, Environment for the future by scientific education – work in nature
HUSKROUA/23/RS/1.2/027 EFFUSE-win, Environment for the future by scientific education – work in nature (zodpovedný riešiteľ: RNDr. Ivana Slepáková, PhD.)
