Ubytovávanie študentov jednotlivých fakúlt univerzity je realizované na štyroch blokoch na Medickej 4, 6, na Popradskej ulici 66 a na Popradskej ulici 76. Ubytovacia kapacita na Medickej ulici je 1 400, na Popradskej ulici 66 celkom 155 osôb a na Popradskej 76 spolu 200 osôb. Celková kapacita ŠD na ubytovanie je 1 755 miest.
Študenti na ŠD na Medickej sú ubytovávaní v dvojlôžkových a trojlôžkových izbách bunkového charakteru. Dve izby tvoria bunku, z toho jedna dvojposteľová a jedna trojposteľová izba. Na jednej bunke majú piati ubytovaní jedno WC, sprchu a umývadlo.
Ubytovanie študentov rozdeľuje komisia zriadená pri rektoráte Univerzity P. J. Šafárika podľa počtu pridelených bodov. Študentské domovy na Medickej 4,6 sú vybavené jednou jedálňou, bufetom, spoločenskými miestnosťami, športovými ihriskami umiestnenými v areáli. Výhodná poloha v blízkosti centra mesta umožňuje študentom pestré kultúrne, spoločenské a športové využitie voľného času, ako aj dobré dopravné spojenie s jednotlivými fakultami. V ŠD na Popradskej 66 sú ubytovaní prevažne študenti FVS. Zahraniční študenti sú ubytovaní v ŠD na Popradskej 76.
Prevádzka stravovacej časti ŠDaJ UPJŠ Medická 4, Košice je zabezpečovaná 55 zamestnancami v štyroch kuchyniach a dvoch výdajniach stravy. Výdajňa na Popradskej ulici, výdajňa na Mánesovej. Príprava stravy je realizovaná na kuchyniach na Medickej 4, Moyzesovej 9, Tr. SNP 1 a Jesennej 9. Od septembra 2015 je v budove Minerva na Moyzesovej ulici otvorená nová kaviareň pre študentov s kapacitou 60 miest.