Vedecko-výskumná činnosť Ústavu lekárskej a klinickej mikrobiológie UPJŚ LF a UNLP sa orientuje:
- na štúdium faktorov virulencie klinicky významných izolátov E. coli na génovej úrovni a na základe ich fenotypových prejavov.
- na zisťovanie genetickej podstaty rezistencie proti antibakteriálnym látkam, s osobitným zameraním na cirkuláciu epidemiologicky významných génov, kódujúcich produkciu ß-laktamáz s rozšíreným spektrom účinku (ESBL) pri vybraných rodoch gramnegatívnych baktérií, izolovaných od pacientov v nemocničnom prostredí.
- v súčinnosti s Klinikou infektológie a cestovnej medicíny UPJŠ LF a UNLP na zavedenie moderných postupov pri laboratórnej diagnostike hypervirulentných kmeňov Clostridioides difficile, pôvodcu závažných nozokomiálnych hnačiek v rámci projektu MŠaSR TRANSFEC „Faktory efektivity fekálnej transplantácie pri kolitíde spôsobenej Clostridioides difficile.
- v súčinnosti s Ústavom lekárskej fyziológie UPJŠ LF na zavedenie vysokorýchlostnej metódy PCR NexGen pre laboratórnu diagnostiku Covid-19 a iných pôvodcov vírusových infekcií v rámci projektu MŠaSR NFP313010ASX1 „Návrh a implementácia pokročilých metód ventilačnej liečby a diagnostiky vírusových pneumónii vrátane Covid-19 s možnosťou ich rýchleho osvojenia“.