V zmysle ustanovení Štatútu Ceny rektora Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach za významný prínos učiteľov a vedeckých pracovníkov Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach v oblasti vedy a výskumu bola Cena rektora v roku 2012 udelená:
- prof. RNDr. Petrovi Fedoročkovi, CSc., za vynikajúce výsledky dosiahnuté v oblasti experimentálnej onkológie pri štúdiu mechanizmov intracelulárnej signalizácie a za významný podiel na budovaní výskumnej infraštruktúry na Ústave biologických a ekologických vied Prírodovedeckej fakulty Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach.
- Dr. h. c. mult. prof. RNDr. Alexandrovi Feherovi, DrSc., za vynikajúce výsledky dosiahnuté v oblasti fyzikálneho výskumu kondenzovaných látok pri nízkych teplotách.
- prof. PhDr. Vladimírovi Leškovi, CSc., za významnú monografickú prácu „Philosophy of the History of Philosophy (Strong and Weak Models)“, rozvíjajúcu teóriu dejín filozofie.