V zmysle ustanovení Štatútu Ceny rektora Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach za významný prínos v oblasti vedeckého poznania učiteľov a vedeckých pracovníkov Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach bola Cena rektora v roku 2009 udelená:
- prof. RNDr. Stanislavovi JENDROĽOVI, DrSc., za významný prínos k teórii ľahkých grafov a za vybudovanie výskumného centra celoeurópskeho významu v teórii grafov;
- prof. MUDr. Ružene TKÁČOVEJ, PhD., za významné výsledky vedeckej práce v oblasti pneumológie, za vynikajúcu grantovú úspešnosť a budovanie Centra excelentnosti pre výskum aterosklerózy;
- prof. JUDr. Petrovi VOJČÍKOVI, CSc., za vydanie významnej monografie Občiansky zákonník a za významné výsledky vo vedeckovýskumnej činnosti.